【本节内容为：999主线剧情梳理，以时间线为线索对剧情解析概括】

为什么会选择先将游戏剧情梳理一遍，而不是从游戏中提及的理论等更加基础的内容开始，是因为比起整合理论、结局收集等内容，剧情本身并不是那么复杂，可以更好地令大家先行了解整个故事。

注：部分内容摘自百度百科，游戏里相关内容会在第二节中进行总结。由于我玩的是Steam的未汉化版本，部分内容如人物名字借鉴了之前汉化组的翻译，其它部分翻译可能稍有不同。

形态发生场（morphogenetic field）是国皇家协会特别研究员鲁伯特·谢多雷克博士（Shieldrake）提出的一种“共鸣”理论。 他认为，不只声音会产生共鸣，事件也会产生共鸣。他将连续发生同类事件的场所称为“形态形成场”，将所发生的同类事件称为“形态共鸣”。简单来说，人与人之间可以通过某种“方式”达到“共鸣”，从而分享信息（类似于脑电波交流但不完全是，详情请阅读第二节）。

而整个事件的核心人物之一，患有脸盲症（Prosopagnosia）的本乡源太郎，受到这个理论的启发，认为只要能够实现人与人之间的“共鸣”，就可以轻松地认别对方的身份。但形态发生场理论只是一个假说，从来没有被证实过。为了证明其为真实的理论，他决定进行一个实验。由于他是制药公司“Cradle pharmaceutical”的老总，他和洼田辉昭、虹崎渚、武藏堂景亲三人一起设计了整个实验。他与他的左右手虹崎渚负责设计实验并执行，科研人员洼田辉昭负责打造机关，武藏堂景亲则负责提供资金支持。

他们绑架了18个初中年龄左右的孩子，这些孩子分别是9对兄弟姐妹，被分成9小组，组内的兄弟姐妹2人分别对应“传输”能力较强和“接收”能力较强两种能力。于是就有了9个“传输”能力较强的孩子，和9个“接收”能力较强的孩子。前9个孩子被划为“Q组”，在内华达沙漠内的Q栋进行实验；后9个孩子被划为“A组”，在巨轮“Gigantic”上进行实验。而实验的内容，则是在“Gigantic”上展开一场“九人游戏（Nonary Game）”。

首先，在Gigantic的一个舱室内放置炸弹并引爆，然后告知船上的9个孩子：“现在船正在下沉，如果想要存活的话，就必须在9小时内找到带有数字9的门，并从该门逃离”。在找到9号门前，必须通过所有门上写有1到8数字的对应8扇门。每个孩子手上都戴有对应数字1到9的腕表，只要腕表上数字加起来所计算出的数字根（Digital Root）和门上的数字相符，就可以通过扫描腕表打开门（关于数字根，见第二节）。但是，只有扫描过的腕表才能通过门，且进入门的人数至少为3人，至多为5人，否则就会触发死亡装置。（例如：1，2，4的数字根为7，戴有这三个腕表的人扫描后，只有这三个人才能通过这扇门）【注：实际上，九年前的开门机制和九年后的稍有不同，但这只关系到了九年后“9号”的死亡，所以暂时可以忽略这一点】

与此同时，在内华达沙漠Q栋内打造与“Gigantic”完全一样的布局和谜题，并告诉“Q组”：“你们要在9小时内解开谜题，找到9号门并将答案传输给A组，不然的话，你们的兄弟姐妹全都会死掉”。出乎意料的是，实验人员在分组运送时，某个环节出了差错，将仓式兄妹分到了同一组。但是哥哥仓式葵（Aoi Kurashiki）是“接收者”，而妹妹仓式茜（Akane Kurashiki）是“传输者”，这就意味着妹妹茜本来应该在内华达沙漠的Q栋内，而现在在Q栋的某个孩子理论上应该和茜互换。但是没有一个工作人员发现这一点。

总之，“九人游戏”还是开始了。

随着游戏推进，茜发现自己经常会感受到童年好友淳平（Junpei）的存在。他和自己在同一艘船上，解着同样的谜题，只是时间是9年后。就像是一个屏幕里同时放映着两个时空的画面，一个是现在的自己看到的景象，另一个是9年后的淳平看到的景象。

游戏过程中，孩子们曾经发生争执，面临信任崩塌。这时，其中一个孩子莱特（Light）让大家都聚集到一起，将口袋里的九棵四叶草分给每个孩子，说道：“今天是我妹妹四叶的9岁生日，她现在正在内华达沙漠的Q栋内，我之前特地去找了9棵四叶草，想送给她。我是一个盲人，对一个普通人而言，找四叶草已经很难了，但我还是去找了，来证明她对我来说非常重要。现在我想把它们送给你们，四叶草的每一片叶子分别代表着信任、信念、爱和幸运。我们要学会去爱，然后拥有信任，怀着信念，这样幸运就会降临在你身上。”于是孩子们又重新团结在了一起。

在接近9小时的时间截点时，孩子们来到了最后一个密室：焚烧室（incineration room）。在焚烧室内只有1扇9号门，这就意味着最多只有5人可以通过。更糟糕的是，与此同时，焚烧室的广播响了起来：

“警告，警告，焚烧指令已下达，即将在18分钟后进行焚烧，请尽快离开该室。”

当孩子们惊慌失措时，头顶的一个通风口被打开，一个壮得像山一样的男人从通风口探出头。他正是刑警赛文（Seven，真名未知），在调查孩童失踪事件时，查到这些孩子们曾经都去过Cradle pharmaceutical的附属医院进行治疗，并得到内部消息：“今晚孩子们会被送到Gigantic上并发船”。当他夜晚在码头探查时被发现，随后被注射麻醉药并关在船上的禁闭室里。醒来后，他从禁闭室的通风口听到孩子的声音传来，于是沿着通风口爬到了焚烧室，见到了9个孩子。他了解情况后，匆忙爬回禁闭室拿绳子，准备将孩子们从通风口吊上来并逃离。同时，仓式葵让可以直接从门通过的孩子先走，于是只剩下了四个孩子：仓式葵、仓式茜、莱特和一个女生。

赛文成功解救了四个孩子，并准备从楼梯逃走。结果跑到一半时，茜发现好友淳平送给自己的小玩偶不见了。这是对茜来说很重要的玩偶，是他们小学毕业的那一天，淳平送给自己的。因为他们之后各自要上不同的初中，很难再见到，于是淳平送了一个玩偶给他，说这个玩偶就是自己，自己会一直陪在茜的身边。

茜发现了之后决定跑回去找，结果果然在焚烧室门口找到了玩偶。但同时，她也被怒气冲冲的本乡源太郎抓住，丢回焚烧室继续实验，只有解开了焚烧室中间电脑上的谜题才能打开大门。但是茜非常害怕，也解不开谜题。关键时刻，她向9年后在同一地点的淳平寻求帮助，结果真的被9年后的淳平接收到了，他完成了同样的谜题并把解法告诉茜，茜于是成功逃离。

而茜很清楚，这只是一个开始。自己被9年后的淳平所救，这就意味着9年后必然需要再次开展一次“九人游戏”，这样自己才能真正活下去。所以，仓式兄妹策划了九年后的“九人游戏”，根据茜之前通过淳平的视角看到的游戏内容和九年前的九人游戏内容，将Gigantic号上的场景完美复刻在内达华沙漠的建筑内，并找来了九个玩家：

1号：本乡源太郎（代号一宫，Ace）

2号：莱特（代号尼尔斯，Snake）

3号：仓式葵（代号Santa）

4号：四叶（代号即四叶，Clover）

5号：淳平（因茜在众人面前直接叫出了他的名字，所以他没有代号）

6号：仓式茜（代号紫，June）

7号：赛文（代号即赛文，Seven）

8号：八代（代号八代，Lotus）

9号：洼田辉昭（无代号，炮灰）

【注：英文为美版翻译，Santa在任何版本里都直接命名为Santa，而赛文和八代真名未在游戏中出现】

除了这九个人之外，船上还有另外两个人，即虹崎渚和武藏堂景亲。

一场复仇和拯救就这样开始了。玩家以淳平为视角进行新一轮的九人游戏......